2003'te olduğu gibi 2004'te de en çok makale yayımlayan üniversitelerin büyük çoğunluğu yine özel üniversiteler oldu. En çok makale yayımlayan ilk beş üniversite arasına sadece iki devlet üniversitesi girmeyi başardı. Özel üniversitelerin gerçekleştirdiği bu başarı, başarılı öğretim üyelerini devlet üniversitelerinden transfer etmeleriyle açıklandı.
2003'te dört ve beşinci sıralara yerleşen ODTÜ ve Boğaziçi üniversiteleri ise 2004'te dereceye giremedi. ODTÜ ve Boğaziçi sıralamadaki yerini Trakya ve Akdeniz üniversitelerine kaptırdı.
YÖK'ün verilerine göre, 2004 yılında, İstanbul, Ankara ve İzmir'deki bazı üniversitelerdeki fakülteler de dahil, çok sayıda fakülte tek bir yayınla bile indekse girmeyi başaramadı. İndekse yayın sokamayan fakülteler arasında hukuk, iletişim, eğitim, ilahiyat, iktisadi ve idari bilimler fakülteleriyle meslek yüksekokulları bulunuyor. En çok bilimsel ve teknolojik yayını ise yine üniversitelerin tıp, fen-edebiyat ve veterinerlik fakülteleri verdi.
Eğitim-öğretime birkaç yıl önce başlayan özel üniversitelerden Yaşar, Okan ve İzmir Ekonomi üniversiteleri ise hiç makale yayımlayamayarak listede son sırada yer aldı. Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi'nde 472 öğretim üyesi 233 yayın yaptı. Böylece öğretim üyesi başına 0.5 makale düştü.
SCI (Science Citation Index) fen bilimleri, SSCI (Social Sciences Citation Index) sosyal bilimler, AHCI (Art and Humanities Citation Index) sanat ve kültür alanında çoklu disipline dayalı makalelerin yer aldı bilgi bankası olarak biliniyor.






